ஒவ்வொரு முதன்மை லிப்போபுரோட்டினும், அதற்கு மட்டுமே உள்ளார்ந்த ஒரு தனிப்பட்ட புரதம் (அபோலிபோபுரோட்டீன்) இருப்பதன் மூலம் வகைப்படுத்தப்படுகிறது. அபோலிபோபுரோட்டின்கள் லத்தீன் எழுத்துக்களால் குறிக்கப்படுகின்றன, மேலும் அவற்றில் சில புரதங்களின் குடும்பத்தைக் குறிக்கின்றன, மேலும் கூடுதலாக எண்களால் குறிக்கப்படுகின்றன (எடுத்துக்காட்டாக, apo-A1, apo-A2, முதலியன).